Genotyping og Phenotyping geta greint, og jafnvel spá, HIV lyf gegn
Jafnvel fyrir fólk með ákjósanlegustu viðbrögð við meðferð, er búist við að einhver þol gegn HIV-viðnám sé að þróast með tímanum vegna náttúrulegra stökkbreytinga á veirunni. Í öðrum tilvikum getur mótspyrna þróast hratt þegar ófullnægjandi viðloðun gerir ráð fyrir ónæmum HIV-íbúum að þrífast, sem leiðir til loka til meðferðarbrests.
Þegar meðferðartruflanir eiga sér stað, verður að velja aðra lyfja samsetningar til þess að bæla þessa nýju sjúklinga ónæmir veiru.
Rannsóknir á erfðaþoli hjálpa til við að auðvelda þetta með því að skilgreina tegundir ónæmar stökkbreytinga í veiruveggi einstaklingsins, en að ganga úr skugga um hversu næmir þessar veirur eru mögulegar andretróveirulyf .
Tvær aðalverkfæri eru notaðar til að prófa erfðaþol í HIV: HIV arfgerðarsvörunin og HIV fenotypic prófunin .
Hvað er arfgerð og fenotype?
Samkvæmt skilgreiningu er arfgerð einfaldlega erfðafræðileg samsetning lífveru, en svipgerð er áberandi einkenni eða einkenni þessarar lífveru.
Genotypic assays (eða genotyping) virka með því að skilgreina erfða leiðbeiningar innan erfðafræðilega erfðaskrárar frumunnar eða DNA. Fenotypic prófanir (eða svipgerð) staðfesta tjáningu þessara leiðbeininga undir áhrifum mismunandi umhverfisaðstæðna.
Þó að tengslin milli arfgerð og svipgerð séu ekki alger, getur erfðafræðilega oft verið fyrirsjáanlegt af svipgerð, sérstaklega þegar breytingar á erfðafræðilegum kóða gefa væntanlegum breytingum á eiginleikum eða einkennum, eins og við að þróa eiturhrif viðnám.
Phenotyping, hins vegar staðfestir "hér-og-nú." Það miðar að því að meta viðbragð lífveru við sérstakar breytingar á umhverfisþrýstingi, svo sem þegar HIV er fyrir áhrifum af mismunandi lyfjum og / eða lyfjaþéttni.
Útskýra HIV Genotyping
HIV genotyping er yfirleitt algengasta tækni sem notuð er til prófunar á viðnám.
Markmiðið með prófuninni er að greina tiltekna erfðafræðilega stökkbreytingar í gag-pol svæðinu af genamengi veirunnar (eða erfðakóða). Þetta er svæðið þar sem gagnstæða transcriptase, proteasa og integrase ensím-markmið flestra andretróveirulyfja- eru umritaðar á DNA-keðjunni.
Með því að stækka HIV-erfðafræðin með því að nota PCR- tækni (polymerase chain reaction) , geta tæknimenn rækt (eða "kort") erfðafræði veirunnar með ýmsum stökkbreytingargreiningartækni.
Þessar stökkbreytingar (eða uppsöfnun stökkbreytinga) eru túlkaðar af tæknimönnum sem greina tengslin milli greindra stökkbreytinga og væntanlega veiru veirunnar við mismunandi andretróveirulyf. Online gagnagrunna geta aðstoðað með því að bera saman prófunarröðina við frumgerðina "villt gerð" veira (þ.e. HIV sem inniheldur engar ónæmar stökkbreytingar).
Túlkun þessara prófana er notuð til að ákvarða eiturhrif næmi, því meiri fjöldi helstu stökkbreytinga sem leiða til aukinnar þéttni lyfjaþols .
Útskýring á HIV-fenóýtingu
HIV fenotyping metur vöxt HIV HIV í nærveru lyfs, þá er það miðað við vöxt vöktunar, villigerðs veiru í sama lyfinu.
Eins og við arfgerðar prófanir, mýkja fenotypic próf gag-pol svæðinu af HIV geninu.
Þessi hluti erfðafræðilegra kóða er síðan "ígrædd" á villt klón með því að nota raðbrigða DNA tækni . Sú raðbrigða veiran sem myndast er notuð til að smita spendýrafrumur in vitro (í rannsóknarstofunni).
Veiruefnið er síðan útsett fyrir aukinni styrk mismunandi andretróveirulyfja þar til 50% og 90% veirubæling eru náð. Þéttni er síðan borin saman við niðurstöður úr eftirlitinu úr villtum gerðum.
Hlutfallslegir "brjóta" breytingarin gefa upp gildissvið þar sem fíkniefni er ákvörðuð. Fjórfaldasti breyting þýðir einfaldlega að fjórum sinnum magn lyfsins væri nauðsynlegt til að ná veiruskemmdum samanborið við það af villtum tegundum.
Því hærra sem falt gildi, því minna veiranlegt er veiran ákveðin lyf.
Þessar gildar eru síðan settar í lægra klínískt og efra klínískt svið, með efri gildi sem gefa hærri þéttni lyfjaþols. (Sjá sýnisskýrslu .)
Hvenær er sýnt fram á erfðafræðilega próf?
Í Bandaríkjunum er erfðabreytingarprófun venjulega gerður á sjúklingum sem ekki eru meðhöndlaðir áður til að ákvarða hvort þeir hafi "keypt" lyfjaþol. Rannsóknir í Bandaríkjunum benda til þess að á milli 6% og 16% af sendu veirunni verði ónæmur fyrir að minnsta kosti eitt andretróveirulyf, en næstum 5% verður ónæmur fyrir fleiri en einum flokki lyfja.
Prófun á erfðaþoli er einnig notaður þegar grunur leikur á eiturhrifum hjá einstaklingum sem eru á meðferð. Prófun er framkvæmd meðan sjúklingurinn heldur annaðhvort að taka bilunina eða innan fjóra vikna fráhvarfs meðferðar ef veiruláan er meiri en 500 eintök / ml. Erfðafræðilega prófun er almennt valin í þessum tilvikum þar sem þau kosta minna, hafa meiri hraða og veita meiri næmi til að greina blöndur villigerðs og ónæmt veira.
Sambland af svipgerð og arfgerðartækni er almennt æskileg fyrir einstaklinga með flókna, fjölnæmi, sérstaklega fyrir þá sem verða fyrir próteasahemlum .
Heimildir:
World Health Organization (WHO). "HIV lyfjaþol." Genf, Sviss; 11. apríl 2011.
Kim, D .; Ziebell, R .; Saduvala, N .; et al. "Stefna í versnandi stökkbreytingum HIV-1 ARV-lyfjaþols: 10 HIV eftirlitssvæði, Bandaríkjunum, 2007-2010." 20. Ráðstefna um Retroviruses og tækifærissýkingar. Atlanta, Georgia; 6. mars 2013; Munnleg samantekt 149.
National Institute of Health (NIH). "Leiðbeiningar um notkun andretróveirulyfja í HIV-1-sýktum fullorðnum og unglingum." Bethesda, Maryland; 11. október 2013.